MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus acidocaldarius N8

Total Repeats: 46505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020246	ATT	2	6	59	64	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020246	AG	3	6	200	205	50 %	0 %	50 %	0 %	449066048
3	NC_020246	AG	3	6	215	220	50 %	0 %	50 %	0 %	449066048
4	NC_020246	ACCGGA	2	12	287	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066048
5	NC_020246	AGG	2	6	336	341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066048
6	NC_020246	AAG	2	6	344	349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066048
7	NC_020246	AGGT	2	8	399	406	25 %	25 %	50 %	0 %	449066048
8	NC_020246	GAG	2	6	455	460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066048
9	NC_020246	AGAA	2	8	496	503	75 %	0 %	25 %	0 %	449066048
10	NC_020246	TAG	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066048
11	NC_020246	AT	3	6	536	541	50 %	50 %	0 %	0 %	449066048
12	NC_020246	ACT	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066048
13	NC_020246	GTAA	2	8	635	642	50 %	25 %	25 %	0 %	449066048
14	NC_020246	ATG	2	6	717	722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066048
15	NC_020246	ATTA	2	8	766	773	50 %	50 %	0 %	0 %	449066048
16	NC_020246	AT	3	6	802	807	50 %	50 %	0 %	0 %	449066048
17	NC_020246	TGC	2	6	808	813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066048
18	NC_020246	GCT	2	6	869	874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066048
19	NC_020246	GGAA	2	8	889	896	50 %	0 %	50 %	0 %	449066048
20	NC_020246	ATA	2	6	926	931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066048
21	NC_020246	AG	3	6	943	948	50 %	0 %	50 %	0 %	449066048
22	NC_020246	AGCT	2	8	987	994	25 %	25 %	25 %	25 %	449066048
23	NC_020246	AGA	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066048
24	NC_020246	TAA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066048
25	NC_020246	ATA	2	6	1145	1150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066048
26	NC_020246	AAGGG	2	10	1154	1163	40 %	0 %	60 %	0 %	449066048
27	NC_020246	GGA	2	6	1166	1171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066048
28	NC_020246	AGA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066049
29	NC_020246	GAG	3	9	1326	1334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066049
30	NC_020246	TAT	3	9	1426	1434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066049
31	NC_020246	AGTA	2	8	1465	1472	50 %	25 %	25 %	0 %	449066049
32	NC_020246	AGA	2	6	1551	1556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066049
33	NC_020246	AATAG	2	10	1561	1570	60 %	20 %	20 %	0 %	449066049
34	NC_020246	TAG	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066049
35	NC_020246	TA	3	6	1633	1638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020246	ATT	2	6	1746	1751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066050
37	NC_020246	AAT	2	6	1766	1771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066050
38	NC_020246	AT	3	6	1799	1804	50 %	50 %	0 %	0 %	449066050
39	NC_020246	TAG	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066050
40	NC_020246	AGT	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066050
41	NC_020246	ATA	3	9	1914	1922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066050
42	NC_020246	AT	3	6	1973	1978	50 %	50 %	0 %	0 %	449066050
43	NC_020246	TTAC	2	8	2025	2032	25 %	50 %	0 %	25 %	449066050
44	NC_020246	TGC	2	6	2102	2107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066050
45	NC_020246	TAA	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066050
46	NC_020246	TGC	2	6	2159	2164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066050
47	NC_020246	ATT	2	6	2259	2264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066050
48	NC_020246	AT	3	6	2309	2314	50 %	50 %	0 %	0 %	449066050
49	NC_020246	TAA	2	6	2371	2376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066050
50	NC_020246	TTA	2	6	2448	2453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066050
51	NC_020246	AT	3	6	2463	2468	50 %	50 %	0 %	0 %	449066050
52	NC_020246	TGA	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066050
53	NC_020246	AAAG	2	8	2559	2566	75 %	0 %	25 %	0 %	449066051
54	NC_020246	T	6	6	2570	2575	0 %	100 %	0 %	0 %	449066051
55	NC_020246	TTTA	2	8	2625	2632	25 %	75 %	0 %	0 %	449066051
56	NC_020246	CTTCCT	2	12	2708	2719	0 %	50 %	0 %	50 %	449066051
57	NC_020246	TTA	2	6	2771	2776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066051
58	NC_020246	CAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066051
59	NC_020246	CTCTTG	2	12	2831	2842	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	449066051
60	NC_020246	TTA	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066051
61	NC_020246	A	6	6	2878	2883	100 %	0 %	0 %	0 %	449066051
62	NC_020246	TTA	2	6	2932	2937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066051
63	NC_020246	ATA	2	6	2946	2951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066051
64	NC_020246	A	6	6	2972	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	449066051
65	NC_020246	TCT	2	6	3070	3075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020246	T	6	6	3138	3143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020246	AAAC	2	8	3166	3173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020246	TTA	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020246	TAACT	2	10	3346	3355	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020246	ATT	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020246	ACTTCA	2	12	3374	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020246	TCT	2	6	3388	3393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020246	TTA	2	6	3470	3475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020246	TAG	2	6	3565	3570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066052
75	NC_020246	TATG	2	8	3634	3641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020246	TTG	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020246	ATAA	2	8	3690	3697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020246	TTG	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020246	A	6	6	3719	3724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020246	TAA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020246	AT	3	6	3789	3794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020246	A	6	6	3795	3800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020246	AAT	2	6	3923	3928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066053
84	NC_020246	CT	3	6	3982	3987	0 %	50 %	0 %	50 %	449066053
85	NC_020246	TCC	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066053
86	NC_020246	T	7	7	4131	4137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020246	ATGG	2	8	4143	4150	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020246	AAC	2	6	4168	4173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020246	TTA	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020246	TAA	2	6	4237	4242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020246	AGA	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020246	CATA	2	8	4284	4291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020246	ATA	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066054
94	NC_020246	AG	3	6	4345	4350	50 %	0 %	50 %	0 %	449066054
95	NC_020246	GAA	2	6	4365	4370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066054
96	NC_020246	AT	3	6	4426	4431	50 %	50 %	0 %	0 %	449066054
97	NC_020246	CTAA	2	8	4442	4449	50 %	25 %	0 %	25 %	449066054
98	NC_020246	A	6	6	4448	4453	100 %	0 %	0 %	0 %	449066054
99	NC_020246	ACT	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066055
100	NC_020246	TCT	2	6	4562	4567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066055
101	NC_020246	AAT	2	6	4571	4576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066055
102	NC_020246	TCC	2	6	4640	4645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066055
103	NC_020246	CTAC	2	8	4649	4656	25 %	25 %	0 %	50 %	449066055
104	NC_020246	AGTG	2	8	4691	4698	25 %	25 %	50 %	0 %	449066055
105	NC_020246	TCT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066055
106	NC_020246	TCT	2	6	4921	4926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066055
107	NC_020246	TTC	2	6	4927	4932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066055
108	NC_020246	CTT	2	6	5028	5033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066055
109	NC_020246	CTA	2	6	5043	5048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066055
110	NC_020246	TA	3	6	5103	5108	50 %	50 %	0 %	0 %	449066055
111	NC_020246	GTA	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066055
112	NC_020246	GA	3	6	5348	5353	50 %	0 %	50 %	0 %	449066056
113	NC_020246	CTC	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066056
114	NC_020246	GAGG	2	8	5524	5531	25 %	0 %	75 %	0 %	449066056
115	NC_020246	CTT	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066056
116	NC_020246	TA	3	6	5591	5596	50 %	50 %	0 %	0 %	449066056
117	NC_020246	AGT	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066056
118	NC_020246	CTT	2	6	5734	5739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066056
119	NC_020246	AAT	2	6	5757	5762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066056
120	NC_020246	TCT	2	6	5881	5886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066056
121	NC_020246	TGA	2	6	5898	5903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066056
122	NC_020246	CAT	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066056
123	NC_020246	CTAA	2	8	6304	6311	50 %	25 %	0 %	25 %	449066057
124	NC_020246	ATT	2	6	6352	6357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066057
125	NC_020246	TGG	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066057
126	NC_020246	ATG	2	6	6452	6457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066057
127	NC_020246	ATA	2	6	6472	6477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066057
128	NC_020246	T	7	7	6494	6500	0 %	100 %	0 %	0 %	449066057
129	NC_020246	TTG	2	6	6518	6523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066057
130	NC_020246	TCC	2	6	6596	6601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066057
131	NC_020246	GAT	2	6	6615	6620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066057
132	NC_020246	AAT	2	6	6636	6641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066057
133	NC_020246	AAT	2	6	6650	6655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066057
134	NC_020246	CTA	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066057
135	NC_020246	GAA	2	6	6714	6719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066057
136	NC_020246	TTA	2	6	6803	6808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066057
137	NC_020246	ATG	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066057
138	NC_020246	TAA	2	6	6869	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066057
139	NC_020246	AAGC	2	8	6956	6963	50 %	0 %	25 %	25 %	449066057
140	NC_020246	GGCTAA	2	12	6987	6998	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449066057
141	NC_020246	TCC	2	6	7005	7010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066057
142	NC_020246	TTC	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066057
143	NC_020246	GGT	2	6	7081	7086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066057
144	NC_020246	TA	4	8	7104	7111	50 %	50 %	0 %	0 %	449066057
145	NC_020246	AGA	2	6	7246	7251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066057
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148	NC_020246	GTT	2	6	7386	7391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066057
149	NC_020246	GA	3	6	7444	7449	50 %	0 %	50 %	0 %	449066057
150	NC_020246	AAT	2	6	7476	7481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066057
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152	NC_020246	TC	3	6	7500	7505	0 %	50 %	0 %	50 %	449066057
153	NC_020246	AT	3	6	7536	7541	50 %	50 %	0 %	0 %	449066057
154	NC_020246	TAT	4	12	7545	7556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066057
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156	NC_020246	CT	4	8	7618	7625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_020246	ACAA	2	8	7636	7643	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_020246	GAA	2	6	7660	7665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020246	AGA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_020246	ATA	2	6	7711	7716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020246	TA	3	6	7728	7733	50 %	50 %	0 %	0 %	449066058
162	NC_020246	CAT	2	6	7816	7821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066058
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164	NC_020246	TATTT	2	10	7874	7883	20 %	80 %	0 %	0 %	449066058
165	NC_020246	TCAA	2	8	7932	7939	50 %	25 %	0 %	25 %	449066058
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167	NC_020246	TTC	2	6	7964	7969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066058
168	NC_020246	TCT	2	6	7992	7997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066058
169	NC_020246	ATA	2	6	8006	8011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066058
170	NC_020246	CAAGC	2	10	8050	8059	40 %	0 %	20 %	40 %	449066058
171	NC_020246	TTTTAA	2	12	8080	8091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066058
172	NC_020246	TAT	2	6	8104	8109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066058
173	NC_020246	TTC	2	6	8151	8156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066058
174	NC_020246	CTAT	2	8	8255	8262	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NC_020246	TA	3	6	8263	8268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020246	TTA	2	6	8316	8321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_020246	T	6	6	8334	8339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_020246	TAC	2	6	8341	8346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_020246	TAA	2	6	8408	8413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066059
180	NC_020246	TGG	2	6	8418	8423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066059
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183	NC_020246	AT	3	6	8449	8454	50 %	50 %	0 %	0 %	449066059
184	NC_020246	ATAGA	2	10	8458	8467	60 %	20 %	20 %	0 %	449066059
185	NC_020246	GTA	2	6	8482	8487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066059
186	NC_020246	TTG	2	6	8497	8502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066059
187	NC_020246	ATTT	2	8	8513	8520	25 %	75 %	0 %	0 %	449066059
188	NC_020246	CTAAA	2	10	8572	8581	60 %	20 %	0 %	20 %	449066059
189	NC_020246	TTC	2	6	8603	8608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066059
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254	NC_020246	TGAAT	2	10	11851	11860	40 %	40 %	20 %	0 %	449066064
255	NC_020246	TGT	2	6	11865	11870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066064
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258	NC_020246	ATA	2	6	12176	12181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_020246	TA	3	6	12207	12212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_020246	GAT	2	6	12239	12244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_020246	CATA	2	8	12505	12512	50 %	25 %	0 %	25 %	449066065
263	NC_020246	TA	3	6	12518	12523	50 %	50 %	0 %	0 %	449066065
264	NC_020246	ATT	2	6	12546	12551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066065
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270	NC_020246	T	6	6	13130	13135	0 %	100 %	0 %	0 %	449066066
271	NC_020246	AGT	2	6	13193	13198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066066
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273	NC_020246	CT	3	6	13207	13212	0 %	50 %	0 %	50 %	449066066
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402	NC_020246	CTT	2	6	18825	18830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066072
403	NC_020246	CTG	2	6	18879	18884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066072
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405	NC_020246	CTT	2	6	18950	18955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066073
406	NC_020246	CAT	2	6	18979	18984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066073
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